| 1998 | С 1 июля существующие акции с установленной стоимостью Bayer AG заменены на акции без фиксированного номинала. |
| 1999 |  Во время празднования столетия торговой марки Aspirin® 6 марта профессиональные альпинисты заворачивают в упаковочный материал высотное здание бывшей штаб-квартиры "Байер" в Леверкузене, таким образом превращая его в самую большую в мире пачку Aspirin® и устанавливая от лица компании 3 новых рекорда, которые вошли в книгу рекордов Гиннеса. |
| 2000 | Приобретение производства полиолов у Lyondell Chemical Company, США. Компания "Байер" становится самым крупным в мире производителем сырья для производства полиуретанов. |
| 2001 | Компания "Байер" приобретает "Авентис Кроп Сайенс" ("Aventis CropScience") за €7.25 млрд. и становится лидером в сфере средств защиты растений. 6 декабря менеджмент компании огласил планы относительно создания независимых дочерних компаний под управлением холдинга. |
| 2002 | В октябре начинает свою работу "Bayer Cropscience AG" - первое юридически независимое подразделение компании "Байер". "Bayer Cropscience" предлагает широкий спектр продуктов для всех секторов рынка средств защиты растений. |
| 2003 | В феврале Всемирная Организация Здравоохранения (ВОЗ) включает ацетилсалициловую кислоту, действующее вещество препарата Aspirin®, в список наиболее важных лекарственных препаратов.
В октябре подразделения Bayer Chemicals AG, Bayer HealthCare AG и сервисная компания Bayer Technology Services GmbH получили юридическую самостоятельность в рамках реорганизации Группы "Байер". В декабре этого же года самостоятельными компаниями стали подразделения «Bayer MaterialScience AG» и сервисные компании "Bayer Business Services GmbH" и "Bayer Industry Services GmbH & Co. OHG". |
| 2004 | В январе всемирно известный торговый знак Группы "Байер" - байеровский крест - отпраздновал свое столетие. |
| 2004 | В июне компания Bayer становится первой частной компанией-партнером Комитета ООН по защите окружающей среды (UNEP) в сфере молодежи и окружающей среды. "Байер" предоставляет материальную поддержку в размере €1 миллион ежегодно для поддержки разнообразных проектов на протяжении трех лет. |
| 2005 | В январе "Байер" завершает приобретение безрецептурного бизнеса компании "Roche", становясь одним из трех наибольших мировых поставщиков безрецептурных препаратов. |
| 2005 | 28 января "Lanxess AG" выходит из состава Группы "Байер". Эта компания продолжает химический бизнес "Байера" и часть его полимерного бизнеса. |
| 2006 | В январе компания "Байер Инновейшнс" ("Bayer Innovation GmbH"), дочернее предприятие, занимающееся разработкой новых сфер деятельности, приобрела компанию "Айкон Дженетікс АГ" (Icon Genetics AG), которая проводила изучение инновационных методов производства и использования генетически модифицированных растений. |
| 2006 | В марте "Байер" объявляет о публичном предложении покупки контрольного пакета акций компании "Шеринг АГ" ("Schering AG"), Берлин, Германия. В декабре "Шеринг АГ" официально переименована в "Байер Шеринг Фарма АГ" ("Bayer Schering Pharma AG"). |
| 2006 | "Доу Кемикал Компани" ("Dow Chemical Company") объявляет о своем намерении приобрести дочернюю компанию "Байер" - "Вольф Вальфсроде" ("Wolff Walsrode"). |
| 2007 | В мае компания "Байер" объявляет, что бывшее высотное здание, в котором располагалась штаб-квартира компании, будет превращено в один из крупнейших в мире медиа-носителей. Завершение проекта по модернизации планируется на 2009 год. |
| 2008 | В марте подразделение "Bayer Healthcare" объявило о подписании договора между собственным Подразделением безрецептурных препаратов (Consumer Care Division) и американской фармацевтической компанией "Сагмел" ("Sagmel Inc.") о покупке портфеля безрецептурных препаратов и профильных активов компании "Sagmel Inc.". 3 июня приобретение бизнеса успешно завершено. |
